تامین کنندگان و اشخاصی که از موسسه طلبکار هستند را می توان با چک بانکی تسویه حساب نمود. بنابراین در این سیستم فرم ویژه ای به نام ثبت چک پرداختی وچود دارد که کاربر از طریق آن می تواند چکهای پرداختی به اشخاص را ثبت نماید. قبل از اقدام به درج چک بانکی کاربر بایستی حساب های بانکی موسسه را در سیستم تعریف کرده باشد و همچنین دسته چک های موجود را به برنامه معرفی کرده باشد تا بتواند برگه چک های صادر شده را  در نرم افزار ثبت و ذخیره نماید. پس از ثبت چک، حساب مشتری و حساب اسناد پرداختنی اصلاح می شود و سند اتوماتیک مربوطه در سیستم درج خواهد شد. هنگام ذخیره کردن چک پرداختی، سیستم کنترل های انجام می دهد که باعث عدم ثبت چک های تکراری می گردد.

با ثبت چک پرداختی، کاربر می تواند رسید ثبت چک را رویت نموده و از آن گزارش چاپی تهیه نماید. رسید ثبت چک همزمان با ذخیره کردن چک ثبت می شود و کاربر می تواند آن را چاپ نموده و یا ذخیره کند.